L'Akatsuki est un groupuscule composé à l'origine de 10 ninjas déserteurs (9 suite au départ d'Orochimaru plusieurs années avant le début de l'histoire), provenant de différents pays disséminés dans le monde. Ce groupe, fondé par Madara Uchiwa, est considéré par les autres ninjas comme étant l'organisation criminelle la plus dangereuse et la plus redoutée du monde. Tous ses membres sont des criminels recherchés de rang S, le plus élevé. Le chef de l'organisation est Pein jusqu'à ce que l'on apprenne que le véritable chef est Madara Uchiwa. L'Akatsuki est maintenant composé de ses cinq survivants et des quatre membres de l'équipe de Sasuke Uchiwa l'équipe "Taka" ce qui fait qu'ils sont neuf. Par contre on ne sait pas si leurs objectifs sont les mêmes et ce que nous réserve le groupe "Akatsuki & Taka".
Membres de l'Akatsuki par ordre d'apparitions dans le manga :
* Itachi Uchiwa (Nuke-nin de Konoha)
* Kisame Hoshigaki (Nuke-nin de Kiri)
* Zetsu (Nuke-nin de Kusa)
* Deidara (Nuke-nin d'Iwa)
* Sasori (Nuke-nin de Suna)
* Tobi alias Madara Uchiwa (Nuke-nin de Konoha)
* Hidan (Village des Rizières, enterré vivant, décédé d'après le Character Book)
* Kakuzu (Nuke-nin de Taki)
* Konan (Nuke-nin d'Ame)
* Pein (Nuke-nin d'Ame)
Anciennement :
* Orochimaru (Sanin, nuke-nin de Konoha, décédé, prisonnier du Genjutsu Susanoo d'Itachi)
Alliance des groupes Taka & Akatsuki depuis le chapitre 404 :
* Tobi (Madara Uchiwa) (Nuke-nin de Konoha)
* Pein (Nuke-nin d'Ame)
* Konan (Nuke-nin d'Ame)
* Zetsu (Nuke-nin de Kusa)
* Kisame Hoshigaki (Nuke-nin de Kiri)
* Sasuke Uchiwa (Nuke-nin de Konoha)
* Suigetsu (anciennement expérience d'Orochimaru, nuke-nin de Kiri. Son frère était un des 7 épéistes de Kiri comme Kisame Hoshigaki et Zabuza Momochi)
* Karin (anciennement sous les ordres d'Orochimaru)
* Jûgo (anciennement expérience d'Orochimaru)